mercredi 12 juin 2019

L'interface d'exploration des données de baguage mise à jour: CRBPOData v2.0 est en ligne

Depuis 2017, tout le monde peut explorer les données de baguage et de mouvements d’oiseaux concernant la France grâce à l’interface dédiée ‘CRBPOData’: https://crbpodata.mnhn.fr/
Une version 2.0 vient d’être mise en ligne, grâce au soutien de la Direction des Systèmes d'Information du Muséum. Cette version tient compte des suggestions d’amélioration qui vous nous avez transmises. Les nouveautés majeures sont :
  • La possibilité de faire des recherches sur plusieurs espèces et/ou sur plusieurs aires géographiques simultanément.
  • La possibilité de sélectionner des mois de l’année de manière exclusive. Cela permet de n’avoir à l’affichage, par exemple, que les données du printemps et de l'hiver, et ainsi de révéler les trajectoires reliant des aires de reproduction à des aires d’hivernages. De la même façon, cela permet d’explorer les changements d’aires d’hivernage (en ne faisant afficher que les données collectées en hiver ; cf. figure).
  • Sur les cartes avec trajectoires, il est possible d’obtenir des informations détaillées en cliquant sur la trajectoire avec la souris (cf. figure). Vous visualisez alors les points de marquage et de contrôle / reprise. En cliquant sur chacun d’eux, vous avez alors la date, le sexe et l’âge de l’oiseau qui s’affichent (et l’espèce, si vous avez fait une recherche sur plusieurs espèces). Par contre, ces détails ne s’affichent que si il y a moins de 1000 trajectoires retournées par la requête.
Mouvements entre aires d'hivernage (Déc.-Févr.) pour le Sizerin flammé
Pour plus de détails sur les fonctionnalités de CRBPOData, consultez le précédent post sur le blog et/ou l’article dédié sur le site du CRBPO.

N’hésitez pas à diffuser largement dans vos réseaux !

Ce site ne pourrait exister sans le travail de milliers de bagueurs français (bénévoles comme professionnels), sans l'implication des ornithologues et sans la participation des particuliers qui communiquent plusieurs milliers d'observations ou de reprises d'oiseaux bagués chaque année.
Un immense merci à tous !

Bonnes explorations de données.

Rédacteurs: Olivier Dehorter et Pierre-Yves Henry


mercredi 15 mai 2019

Manuel de Conservation du Phragmite aquatique


Projet démarré il y a presque de 10 ans, le manuel de conservation du Phragmite aquatique (Aquatic Warbler Conservation Handbook) a vu le jour courant 2018. Cet ouvrage couvre de très nombreux domaines, allant des dernières informations sur la biologie de l'espèce, son habitat et les différentes phases de son cycle biologique, en passant par les menaces, la recherche, la communication et les outils pour financer les projets.
Les données sur la migration en France provenant du travaildes bagueurs du CRBPO dans le cadre du thème ACROLA sont intégrées dans le chapitre 2.9 "Migration", en collaboration avec les partenaires espagnoles et belge.
L'ouvrage est disponible gratuitement au téléchargement sur la page du programme LIFE qui a permis l'aboutissement du projet (LIFE Schreiadler) ou sur la page présentant le Plan National d'Actions en faveur de l'espèce en France, hébergé par Bretagne Vivante. 

Table des matières:




































Référence: 

Tanneberger, F., & Kubacka, J. (eds) (2018). The Aquatic Warbler Conservation Handbook. Brandenburg State Office for Environment, Potsdam, Allemagne, 262 p.


Rédaction: Christine Blaize

lundi 6 mai 2019

Épidémie de trichomonose au sein des populations de fringillidés hivernant dans le Boulonnais


Verdier d'Europe atteint de trichomonose (Photo: F. Cavalier)
Au cours du Suivi des Populations d'Oiseaux Locaux aux Mangeoires, les bagueurs du CRBPO suivant les populations d’oiseaux hivernantes dans le Nord-Pas-de-Calais ont contribué, en collaboration avec les Laboratoires Départementaux d’Analyses et le Muséum National d’Histoire Naturelle, à étudier l'émergence de la trichomonase des fringillidés en France. La trichomonase aviaire est une maladie parasitaire causée par le protozoaire Trichomonas gallinae. Communément appelée chancre, cette maladie est largement répandue au sein des populations de columbidés et de rapaces. Suite à un premier évènement épidémique en Grande-Bretagne en 2005, cette maladie est devenue émergente au sein des populations de fringillidés et se propage à travers l’Europe en lien avec les mouvements migratoires des oiseaux. Causée par une souche unique de T. gallinae, la trichomonase des fringillidés apparait comme un facteur prépondérant, responsable du déclin des populations de verdiers d’Europe et de pinsons des arbres au Royaume-Unis (Robinson et al. 2010, Lawson et al. 2018) et en Finlande. En France, la maladie a été suspectée dès 2007 et confirmée en 2011 (Gourlay et al. 2011), sur la base des données et carcasses collectées par les bagueurs. Chavatte et al. (2019) viennent de publier une étude qui décrit l’épidémie qui a affecté les populations de verdiers d’Europe et de chardonnerets élégants hivernant dans le Boulonnais en début 2017. Ils identifient T. gallinae comme l’agent pathogène responsable de cette épidémie et confirment au niveau génétique que la souche parasitaire est identique celle à responsable des épidémies observées au Royaume-Unis et en Europe. Cette étude fournit des données préliminaires sur la dispersion et la survie des individus atteints,; et fait un point sur la maladie en France notamment concernant les événements antérieurs et sa surveillance. Enfin, cette étude insiste sur le rôle probable joué par les pratiques anthropiques tel que le nourrissage sur l’accélération de la transmission de la maladie.


Références:

Une vidéo accompagne cet article, illustrant un des signes cliniques de la maladie sur un verdier d’Europe (vidéo réalisée lors d'une session d'étude des oiseaux hivernants, et juste avant que l'oiseau ne soit relâché): https://www.parasite-journal.org/articles/parasite/olm/2019/01/parasite180155/parasite180155.html ou ici https://twitter.com/i/status/1115171169131352066.

Gourlay P, Décors A, Jouet D, Treilles D, Lemberger K, Faure E, Moinet M, Chi J, Tyler K, Cunningham A, Lawson B. 2011. Finch trichomonosis spreads to France. European Section of the Wildlife Disease Association Bulletin, 2, 9-10

Lawson, B., R. A. Robinson, M. P. Toms, K. Risely, S. MacDonald, and A. A. Cunningham. 2018. Health hazards to wild birds and risk factors associated with anthropogenic food provisioning. Philosophical Transactions ofthe Royal Society B: Biological Sciences 373: 20170091.

Robinson, R. A., B. Lawson, M. P. Toms, K. M. Peck, J. K. Kirkwood, J. Chantrey, I. R. Clatworthy, A. D. Evans, L. A. Hughes, O. C. Hutchinson, S. K. John, T. W. Pennycott, M. W. Perkins, P. S. Rowley, V. R. Simpson, K. M. Tyler, and A. A. Cunningham. 2010. Emerging Infectious Disease Leads to Rapid Population Declines of Common British Birds. PLOS ONE 5: e12215.

Rédacteur: Jean-Marc Chavatte